Wenn du es mit den Öffis nach Manhattan schaffen willst, kannst du für jede Richtung, mit ein bisschen Reserve, 75 Minuten einplanen. Wenn eine Baustelle ist und aus einem Express ein Local Train wird, dann dauert es ggf. deutlich länger. Mit einem Taxi dürfte es nicht unbedingt schneller gehen. LIRR ist auch eine Option, dann musst du aber ggf. (je nachdem was du vorhast) in Manhattan noch irgendwie umsteigen. Das relativiert dann evtl. den Zeitvorteil. Kommt halt darauf an, wo du hinwillst.
Sind also schon sicher 150 Minuten weg. Einreise zu der Zeit kann schnell gehen, ist aber auch davon abhängig, ob du an einen Automaten gehen kannst. Um irgendetwas zum Rechnen zu haben, 60 Minuten.
Abhängig von deiner Destination musst du auch rechtzeitig wieder am Flughafen sein. GRU und STI sind beides keine domestic Ziele, also eher am Airport sein. Die häufig empfohlenen 3 Stunden sind da sicher nicht in deinem Sinn. 90 Minuten klingen aber schon nicht sinnlos - außer du hast die Möglichkeit, mit Prio durch die Sicherheitskontrolle zu kommen.
75+75+60+90=300.
5 Stunden sind also schon weg. Wenn du das Risiko eingehen magst, kannst du 3 Stunden in Manhattan verbringen. Auch wenn es lediglich 3 Stunden sein sollten, lohnt sich.
Wie viel Zeit es dann am Ende ist, wirst du, falls du es denn machst, bereits nach der Einreise (musst du eigentlich Gepäck abholen oder geht das durch? Würde ansonsten zusätzlich Zeit kosten.) und konkreter nach Ankunft in Manhattan wissen.
Von Amsterdam AMS zu Amsterdam Centraal geht es in weniger als 20 Minuten mit der Bahn und du bist mittendrin. Da ist AMS schon deutlich besser an die Stadt angebunden. Dafür ist Amsterdam aus meiner Sicht aber auch bei weitem nicht so spannend wie NYC. Im Zweifel einmal nach Manhattan rein fahren, schnell was essen und dann wieder zurück.