Mir wurde von LH bei Problemen mit einem über LH.com gebuchten GW Flug mal erklärt, dass Lufthansa die GW Flüge wie ein Reisebüro vermittelt und man somit, ausser für die Umbuchung, für keine Ansprüche zuständig sei. Ich könnte mir vorstellen, dass daher jede Buchungsseite ein eigenes Kontigent an gewissen Preisklassen hat und so die Unterschiede entstehen.
Ich hatte vor Kurzem einen Flug CGN-SZG gesucht und habe bei Lufthansa, Germanwings und Austrian geschaut. Bei Lufthansa kostete der Flug für zwei Personen über 400,-, bei Germanwings um die 350,- und bei Austrian rund 290,- -immer der gleiche GW Flug mit Gepäck etc. (Smart). Dazu kam noch, dass es bei LH am wenigsten Meilen gab... Ein Vergleich empfiehlt sich daher immer.