Doch, funktioniert.
lufthansa.com => Meine Buchungen => Buchung ansehen oder ändern => entsprechende Buchung aussuchen und ändern
Dort runterscrollen zu Visa und Einreisedaten => Einreise und Visa Daten eingeben.
Da gibt es dann ein Feld für die KTN:
Anhang anzeigen 72929
Genauso hat es bei mir vor ein paar Wochen mit TSA Pre auf einem domestic UA Flug geklappt: Buchung war FRA-CPH-SFO-SNA (LH-SK-UA). Ich habe die KTN wie oben beschrieben vor Abflug auf lh.com hinzugefügt, und als ich mir in SFO eine neue Bordkarte bei der Wiederaufgabe des Gepäcks geholt habe (ich musste eh' zum Check-In, da der Transitgepäckschalter unbesetzt war), hatte diese TSA Pre drauf. Am Rückflug übrigens genauso.