Ich buche gerade etwas ähnliches: AMS-HAM-FRA-AMS mit etwa 23h in FRA. Günstigste Möglichkeit ist eine E/W-Kombi, da die E-Klasse wie schon geschrieben keine Transfers zulässt. Preis etwa 210 EUR, also deutlich teurer als E-Klasse.
Von mir betrachtete Alternativen:
Eine Gabel-E AMS-HAM//FRA-AMS mit einem oneway-E HAM-FRA (ca. 190 EUR mit TSC, 170 ohne). Das sollte auch für Deine Strecke gehen.
Gabel-E mit Air Berlin HAM-FRA (ca.140 EUR)
Gabel-E mit DB in der Mitte (59 EUR waren für die Bahn aufgerufen).
Letztendlich wird es wohl die E/W-Kombi wegen mangelnder Verfügbarkeit der E-Klasse zwischen FRA und AMS am Wunschtag. W ist heutzutage ja fast schon eine wertige Buchungsklasse